В настоящее время сферой клинических и научных интересов является хирургия (преимущественно лапароскопическая) желудка, толстой кишки, печени и поджелудочной железы.
Прошёл стажировки в ведущих клиниках Англии, Германии, Чехии, Кореи, Китая.
Активно совмещает лечебную работу с научной деятельностью. Автор 185 научных работ, 12 учебных пособий, 46 рационализаторских предложений и 9 изобретений, посвященных вопросам клинической онкологии и хирургии.
Регулярно участвует в тематических научных конгрессах, в том числе зарубежных (США, Швейцария, Германия). Являюсь членом Ассоциации онкологов России, Ассоциации онкологов северо-запада, Пироговского общества хирургов Санкт-Петербурга, Российского общества колопроктологов, Общества специалистов по онкологической колопроктологии, Общества хирургов колопроктологов и гастроэнтерологов, Американского общества хирургов-колопроктологов, Европейской ассоциации колопроктологов.
Аккредитован и включён в Федеральный реестр экспертов научно-технической сферы (регистрационный номер 7252).
Под руководством Захаренко А.А. защищены 3 кандидатские диссертации (Вовин К.Н., Тен О.А., Киселёва Е.В.). Является научным руководителем 3 аспирантов (Свечкова А.А., Шило П.С., Вервекин И.В.), 3 соискателей на учёную степень кандидата медицинских наук (Натха А.А., Зайцев Д. А., Трушин А. А.) и 1 соискателя учёной степени доктора медицинских наук (к. м. н. Беляев М.А.).
Является главным исследователем (PI) в ряде крупных отечественных и международных клинических исследований. Организовал отечественное РКИ «GASPACCO» Oncological Benefits of Pressured Intraperitoneal Aerosol Chemotherapy (PIPAC) in Patients With T3-4 Gastric Cancer Cyt- (ClinicalTrials.gov Identifier: NCT04595929). Соисполнитель значимых отечественных РКИ (COLD). Руководит 9 клиническими исследованиями.
С 2021-22 годы являлся Наставником в «Школе практической онкологии имени А. Н. Павленко» по специальности «Онкоколопроктология».
В июне 2020 года организовал и руководит образовательным проектом «Онкология от А до Я», направленного на непрерывное медицинское образование и повышение онконастороженности и онкологической грамотности врачей. Основная работа проводится в социальных сетях, где в разном формате публикуется обзор и анализ научных работ, гайдлайнов, клинических случаев и этапов операций. За 3 года организовано 9 научно-практических конференций. Организовал научное общество молодых учёных «Онкология от А до Я», в котором состоит более 100 человек. В 2023 году проведён Первый международный молодёжный онкологический форум «гОНКа». Отвечает за организацию 2 этапа Всероссийской студенческой олимпиады по онкологии и отборочного тура международной олимпиады «CancerQuest». География участников проекта охватывает всю страну (
https://t.me/oncoA_Z), (
https://www.youtube.com/channel/UCRTFYqRq3GME8_AehZxghvQ)
Женат. Имеет 4 детей.